Los semilleros de investigación de la Universidad de Pamplona, están conformados por estudiantes de pregrado que participan como asistentes de investigación en los proyectos de investigación que formulan, ejecutan y finalizan los grupos de investigación de la Universidad.

• Grupo de Investigación en Enfermedades Parasitarias, Tropicales e Infecciosas (GIEPATI).
• Ecología y Biogeografía (GIEB)
• Biotecnología Vegetal
• Biología Molecular y Genética (BIOMOGEN)