La maestría en ciencias de la actividad física y el deporte  fue aprobada  por acuerdo del concejo superior de la universidad de pamplona  N° 072 del 9 de septiembre  del 2002. A su vez  el ministerio de educación nacional  por resolución  número 1673 del 21 de julio de 2003 autoriza el funcionamiento del programa  en su esencia académica empezó a ofrecerse. La maestría en ciencias de la actividad física y el deporte  cumplió sus primeros 11años en septiembre  del 2013. Durante este tiempo directivos, docentes y estudiantes han procurado y alcanzado logros importantes en distintos campos del que hacer universitario, a saber: capacitación profesoral; organización de congreso internacional  en ciencias de la actividad física, deporte y salud; creación de la revista actividad física y desarrollo humano  mejoramiento de la planta física; entre otros. Estos han sido liderados por los  distintos directores desde su inicio, hasta el actual.

Los primeros  egresados de la maestría  obtuvieron su título en  el año 2005, y desde entonces cada año un promedio de 5 a 8  estudiantes obtienen su título de magísteres en ciencias de la actividad física y el deporte, es así que a diciembre del 2013 la maestría  cuenta con  68 egresados, Dando inicio el año 2014 a  la cohorte XV con 15 estudiantes.

Actualmente, la maestría cuenta con 29 docentes internos  entre ellos hay 6 doctores con  especialidades  en las diferentes areas de la actividad fisica y del deporte y salud 23 docentes con maestria  en  actividad fisica y deporte y en salud, y con 1 un doctor externo, comprometidos con la profundizacion  y desarrollo de los saberes en las ciencias de la actividad física y el deporte.

La maestría en ciencias de la actividad física y deporte, está  apoyada por la investigación para el desarrollo de la excelencia en los profesionales, con 4 líneas de investigación: La Actividad Física,  Entrenamiento Deportivo.  Educación Física y la Recreación.

La maestría ha venido desarrollando el congreso internacional en ciencias de la actividad física, deporte y salud cada 2 años  este año 2014 se  liderara el VI  Congresos internacionales en ciencias de la actividad física, deporte y salud y III  congreso Iberoamericano de  Investigacion en salud.

 La  revista actividad física y desarrollo humano, es otro de los tantos apoyos para el desarrollo  de la investigacion para la proyección  de estos, donde los estudiantes   hacen sus aportes de profundizacion  quedando registrados en las ponencias y en la revista.

El campus para el desarrollo de la maestría  en ciencias de la actividad física y el deporte  es de profundización contando con los laboratorios de fisiología,biomecánica y los laboratorios de practicas de atletismo,baloncesto,natación,futbol,gimnasia,danzas,voleibol etc.