Estandarización de una técnica para la certificación de jardines clonales de plantas de cacao(Theobroma cacao) usando marcadores moleculares rapd

Jessika Andrea Hernández Garcia¹, Jherson Ariza Garcia, Herminsul de Jesús Cano Calle¹, Jorge Contreras Pineda²

¹ Escuela de Química Universidad Industrial de Santander.Colombia

²Facultad de Salud de la Universidad de Pamplona.Pamplona.Colombia

Resumen

Se estandarizó una técnica para certificación de jardines clonales de plantas de cacao utilizando marcadores moleculares RAPD, se analizaron las variedades CCN-51, TSH-565, ICS-60, ICS-95, IMC-67 y se compararon  los clones existentes en el jardín clonal con sus lotes de injertación;  para ello se utilizaron 8 primers capaces de generar mayor número de polimorfismos distinguidos mediante la electroforesis de productos de PCR. Los resultados obtenidos muestran que las variedades IMC-67, CCN-51, ICS-95 presentan mayores índices de similitud que las variedades ICS-60, TSH-565. Se encontraron que los índices de similitud están dentro del rango de confiabilidad reportado de los marcadores moleculares RAPD, permitiendo la certificación de estos lotes de injertación pertenecientes al jardín clonal del SENA sede Aguas Calientes municipio el Playón Santander, Colombia. Cabe destacar que la técnica RAPDs permite discriminar clones de aquellos individuos que no lo son.

Palabras claves:   Polimorfismos, RAPD, caracterización molecular, extracción de ADN, amplificación de ADN.

Standardized technique for certification of gardens clonal cocoa plants  (Theobroma cacao) using molecular markers rapd

Abstrac

A standard technique was certificated for clonal gardens of cocoa plants using RAPD molecular markers, analyzing varieties CCN-51, TSH-565, ICS-60, ICS-95, IMC-67 comparing the existing clones in clonal garden with lots grafting. Eight primers were used, capable of generating greater number of polymorphisms distinguished by electrophoresis of PCR products. The results obtained show that the IMC-67 varieties, CCN-51, ICS-95 have higher rates of similarity with ICS-60 and TSH-565 varieties. We found that the similarity indices are within the range of reported reliability of RAPD molecular markers, allowing certification of these lots of grafting clonal garden belonging to SENA of the Aguas Calientes, Playón, Santander, Colombia. Importantly, the technique allows to discriminate clones RAPDs individuals who are not.

Keywords: Polymorphism, RAPD, molecular characterization, DNA extraction, DNA amplification